医院历来重视课程体系的建设与改革，坚持“理论课与实习课并重”的课程体系建设原则，以培养学生自学能力和创新思维为重点。通过整合课程、更新内容、创新教学方法和教学手段、增强双语教学力度、强化临床实践技能的培训，较大幅度地提高了临床课程的讲授水平，使学生理论水平、技能水平、基础知识水平等综合素质得到提高，保证培养目标的实现。    

经过几年的努力和探索，医院开设的各门临床课程与教材、大纲相适应，紧密了课程间纵向和横向的联系，形成系统而规范的教学模式，发展了一批校级、院级的精品课程和重点课程，促进了医院整体教学水平的提高。    

厦门大学校级精品课程：      

《诊断学》

《外科学》

厦门大学医学院第一批重点课程：      

《诊断学》

《内科学》

《外科学》

《妇产科学》

厦门大学医学院第二批重点课程：      

《儿科学》

《神经病学》

《医学影像学》

《皮肤性病学》